以科技优势带动高素质人才的培养和学校的全面发展，是南京理工大学办学的指导方针之一。据江苏省教委对全省60所高校的统计，从1991年至今，南京理工大学的科技经费累计总量位居第一，而在科技为经济建设服务方面，南京理工大学业绩出众，科技服务项目经费实现额、专利发明拥有量、科技成果转化率等八项指标名列前茅。
作为国防科工委直属的全国重点大学，南理工具有军工学科的科技优势和较为雄厚的科研实力。“七五”以来，通过深化科技体制改革，学校的科技实力不断增强，为国防现代化和国民经济建设作出了重要贡献。同时也带动了学校学科建设和高素质人才培养，为建成国内一流的理工大学奠定了扎实的基础。
南理工把科技创新作为促进科技发展、组织开展科技活动的主要指导思想。具体内容包括：
坚持以市场定位科技、以转化检验科技和以创新发展科技的标准，着眼于国家经济建设中的高新技术领域，确保思路创新；坚持以学术价值为参照，以市场需求为导向，强调科研开发选题的创新性、应用性、产业化的标准，确保选题的立项创新；坚持以学科为依托的群体化、集约化科技创新机构，实行人才资源和科研资产的重组，确保科技管理模式创新。
创新使南理工的科技工作成绩斐然。历年来，学校共获得部省级以上奖励589项，其中国家级奖65项；拥有国家级专利206项，其中50余项专利获国际国内发明展览会奖牌。学校的科技贸易活动覆盖了全国26个省市区，一大批高科技特色成果，像机电一体化技术、民爆与精细化工技术等，在国家经济建设和社会发展中发挥了突出作用。
学校科技创新的整体氛围有效地引发了学生的科研兴趣，培养了学生的科技创新意识和实践能力。在1991、1993、1995年的“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛中，南理工的成绩名列前茅，1997年，学校成功地承办了第五届“挑战杯”竞赛，取得了理工类团体总分第一的好成绩。
产学研合作是当今世界各国推动经济发展、提高综合国力的一条成功经验，也是实现科技、经济、教育与社会协调发展的有效手段。南理工在强化产学研联合中，主要注重三个转变，即松散型合作向紧密型合作转变、粗放型合作向集约型合作转变、单元型合作向多元型合作转变。
“八五”以来，南理工通过与企业建立科技协作关系所取得的民品科技经费达2亿元，约占全校民品科技经费总额的90％。通过强化校企之间的产学研合作，学校与企业在技术、资金和营销方面实现了优势互补。超大屏幕全彩色显示屏、计算机集成制造系统、柔性制造系统、特种超细粉体技术等一批科研成果已投入经济建设，其中，“特种超细粉体技术”已形成产业规模。
成果转化与市场实现是科技工作的根本目的。近年来，南京理工大学通过政策鼓励和制度把关等措施，引导科技人员转变观念，从而保证了较高的科研成果转化率。
学校的经费分配政策不断向科技成果转化倾斜，凡技术转让经费，校财务只留极少的公耗费和管理费，其余视作项目成本，由课题组使用，在专业技术职称评定方面，学校把专职从事科技开发与成果转化人员晋升技术职务单列一个序列，侧重考核申报人员从事成果转化工作的业绩，论文的发表情况仅作参考。学校同时规定，除军品和纯基础理论课题外，其他选题立项必须有市场需求、有企业介入，力求使学校的科研工作贴近经济发展和企业需求。
据了解，“八五”以来，南理工的科研成果转化率达到50％以上，创造了显著的经济效益，为经济建设做出了突出贡献。仅“新型无梯膨化硝胺炸药及其制造工艺”和“塑料导爆管非电起爆系统”两项成果，已在全国80多家大中型企业推广应用，累计新增产值20亿元，利税逾5亿元。
经过多年的培育与建设，南京理工大学迄今已形成机电一体化、光电与电子信息、民爆与精细化工、新材料与新工艺、安全与防范等五大类优势技术群，培养出一支既能攻克尖端技术又能服务于经济建设的高水平的科研队伍。
进一步服务经济建设，加强对外合作，是南京理工大学科技发展的主要方针。仅去年一年，该校就接待来校寻求合作者2000人次，签订各类技术合同180多项，合同成交额7000多万元，其中已实现项目经费4150多万元。
以科技优势带动学科建设和学校发展，为国家培养高层次、高质量的优秀人才，是南京理工大学不懈追求的办学目标。近年来，全校有700多人次获得国家和省级优秀教学成果奖、优秀教材奖、优秀课程奖等教学奖励500多项；在江苏地区高校历届大学生数学、物理竞赛中屡次夺魁。去年6月，国家发展计划委员会正式批准南京理工大学的“211工程”建设规划。学校正加快建设步伐，力争早日建成国内一流的理工科大学。
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